據鄉老口碑，吳公真仙於清康熙35（西元1696）年間，與內門紫竹寺 觀音 佛祖同船由先民蕭槐公奉請渡台，定居於台灣縣羅漢門中埔 頭（今高雄縣內門鄉觀亭村），於農曆10月初9安座奉祀，後來先民為紀念此日子一併為吳公真仙祝壽。光緒乙末（西元1895）年，荖河番亂到處搶劫放火燒庄，當時紫雲宮重要古文物盡失。據史載紫雲宮於道光庚子年（西元1840年）重修，因光緒乙未年（西元一八九五年）日本侵佔台灣，南庄劉何番聚眾反亂，其所到之處莫不煙火四起，損壞民家器具雞犬不留，紫雲宮重要古蹟文物也 因之盡失，致使諸多資料無從查起，吳公真仙金身也被無情火燒燬剩 餘頭部，經擇日重雕吳公真仙金身，開光點眼，並遷居至中埔 頭先民陳本公（陳日炎先生之先祖）府中奉祀。 　　

自清末至民國年間由陳本公兼任管理。至民國四十八年由蕭顯先生接 任管理人，其熱心宮務，到處廣結善緣，籌募經費購買土地，勞心勞力策畫藍圖重建紫雲宮，於民國四十九年動工至民國五十七年九月峻 工安座大典，廟宇煥然一新，奠定紫雲宮今天的基礎。民國六十八年經改組成立管理委員會，全體委員在吳公真仙案前憑擲 金杯由鄧接明先生擔任主任委員，鄧主委即延聘熱心信徒代表暨委員 參與會務。 　

　由於香客與日俱增，地方諸大德及紫雲宮信徒，鑒於原有殿宇規模簡陋，不敷使用，眾議整修重建，並在紫雲宮邊購買兩筆土地，乃在吳公真仙案前徵得答應，經規劃藍圖，預定擴建總面積為二百五十餘坪，餘民國八十五年農曆八月初二戌時動土開工興建，因緣時會適逢吳公真仙渡台三百週年紀念年。紫雲宮重建材設備經費龐大，總工程費預估合計一億多元，在諸善信大德贊助下完成富麗堂皇廟堂，至今工程尚未完成，92年農曆11月16日安座奉祀於左殿。紫雲宮吳公真仙時時刻刻為諸善信大德，解決艱苦病痛及各種疑難雜症，凡有所求無不靈驗。三百餘年來顯化無數大小靈異奇蹟，香火鼎盛，每逢星期假日或朔望及聖誕農曆十月初九日，由全省各地湧來朝拜或許還愿者，絡繹不絕，盛況空前。

入廟門左青龍右白虎。

紫雲宮吳公真仙神威顯赫，普濟群生，庇佑地方安寧，功不可沒，所以每當內門紫竹寺觀音佛祖二月十九日聖誕廟會遶境時，必定邀請吳公真仙金身坐大轎同遊庄。